Trzykrotnie nagrodzony Laurem Umiejętności i Kompetencji Opolskiej Izby Gospodarczej za wkład w rozwój lokalnego środowiska akademickiego. W 2010 r. otrzymał Medal Komisji Edukacji Narodowej. Ponadto został nagrodzony medalami przez Uniwersytet w Brnie i Politechnikę w Braganzy. Otrzymał tytuł Zasłużonego obywatela Opola. W 2017 r. nadano mu tytuł Honorowego obywatelem gminy Polska Cerekiew.
Zmarł śmiercią samobójczą. Pochowany na cmentarzu w Czarnowąsach.
17 lipca 2020 r. w uhonorowaniu zasług profesora Marka Tukiendorfa na rzecz rozwoju opolskiej nauki i przemysłu jego imię nadano Parkowi Naukowo-Technologicznemu w Opolu.
Współpraca międzynarodowa Był pełnomocnikiem rektora Politechniki Opolskiej ds. powstania – Instytut Konfucjusza w Opolu. W czasie gdy był rektorem Politechniki Opolskiej zorganizowała ona konferencję międzynarodową „One Belt, One Road”, a profesor Tukiendorf reprezentował polską stronę w kierownictwie polsko-chińskiego konsorcjum akademickiego mające na celu wspólne powadzenie badań naukowych w ramach programu „One Belt One Road”. Współdzielił funkcję przewodniczącego polsko-chińskiego konsorcjum akademickiego (Sino-Polish University Consortium) zrzeszającego 14 chińskich i 12 polskich uczelni.