Uczelnia realizuje także projekty we współpracy z instytucjami krajowymi i europejskimi, w tym finansowane ze środków Unii Europejskiej oraz Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego. Przykładem jest projekt „Modyfikacja programu studiów II stopnia na kierunku Dietetyka w Wyższej Szkole Inżynierii i Zdrowia”, współfinansowany z Funduszy Europejskich dla Rozwoju Społecznego 2021–2027 (FERS), w ramach Priorytetu I „Umiejętności”, Działanie 01.05 „Umiejętności w szkolnictwie wyższym”.
Współpraca międzynarodowa Warszawska Akademia Medyczno-Techniczna Nauk Stosowanych prowadzi działania w zakresie internacjonalizacji kształcenia. Uczelnia współpracuje z zagranicznymi instytucjami szkolnictwa wyższego w ramach programu Erasmus+.
Umowy bilateralne podpisano z uczelniami z wielu krajów europejskich, m.in. z Bułgarii, Cypru, Chorwacji, Czech, Francji, Grecji, Hiszpanii, Litwy, Łotwy, Macedonii Północnej, Portugalii, Rumunii, Słowenii, Turcji i Włoch.