XIX wieku do szkoły dobudowano salę gimnastyczną oraz budynek mieszkalny, natomiast dekadę później przebudowano sam gmach szkolny.
Przebudowany gmach szkolny, przy ówczesnej ul. Sątoczeńskiej, ponownie uroczyście otworzono 17 października 1872 roku, a pierwszym dyrektorem mieszczącego się w nim Państwowego Gimnazjum Męskiego został dr Alfred Schottemuller. Księgozbiór biblioteki powstał w większości ze składek mieszczaństwa miast warmińskich, w tym na osobiste polecenie biskupa Ignacego Krasickiego, Lidzbarka Warmińskiego. W 1876 roku do szkoły uczęszczało 300 uczniów, przy czym 168 z nich nie pochodziło z Bartoszyc. W ciągu pierwszych 25 lat pracy gimnazjum egzamin dojrzałości złożyło 166 uczniów najwyższej klasy oraz 9 eksternów.
Okres powojenny (po 1945) Po zakończeniu II wojny światowej szkoła, jak i miasto Bartoszyce, znalazła się pod zarządem polskiej administracji. Podczas działań wojennych budynek nie ucierpiał znacznie, lecz księgozbiór biblioteczny został zniszczony i rozgrabiony.
1 grudnia 1946 roku, dzięki inicjatywom społeczeństwa oraz poparciu samorządowych władz lokalnych, w szkole rozpoczął się pierwszy rok szkolny.