Pierwszą dywizję ze składu PdGW wycofano do ZSRR w 1988. Planowe wycofanie wojsk z terytorium Węgier rozpoczęło się w maju 1989. Pierwsza opuściła Węgry 13 Dywizja Pancerna i szkolny pułk czołgów, które zostały rozformowane. 19 Dywizja Pancerna została wycofana do Białoruskiego Okręgu Wojskowego, a 254 Dywizja Zmechanizowana – do Kijowskiego Okręgu Wojskowego. PdGW została formalnie rozwiązana 16 czerwca 1991, a ostatni żołnierz Federacji Rosyjskiej opuścił terytorium Węgier w 1992.
Dowódcy drugiej PdGW: 1956–60 gen. płk Michaił Kazakow; 1960–61 gen. płk. Matwiej Nikitin; 1961–62 gen. armii Pawieł Batow; 1962–69 gen. płk Konstantin Prowałow; 1969–75 gen. płk Boris Iwanow; 1975-79 gen. płk Fiedot Kriwda; 1979-82 gen. płk Włodzimierz Siwienok; 1982–85 gen. płk Konstantin Koczetow; 1985–88 gen. płk Aleksiej Demidow; 1988–90 gen. płk Matwiej Burłakow; 1990–92 gen. por. Wiktor Szyłow.
Zobacz też Północna Grupa Wojsk Zachodnia Grupa Wojsk Centralna Grupa Wojsk Układ Warszawski