Postanowiono podzielić cały patriarchat na pięć metropolii dzielonych następnie na eparchie. Najwyższym organem wykonawczym miała być Wyższa Rada KościelnaNazwę organu tłumaczy się czasami też jako Wyższy Zarząd Cerkwi.. złożona z przedstawicieli wybranych przez Synod (3 biskupów) oraz wybranych przez Sobór Lokalny (1 mnich, 5 białych duchownych i 6 świeckich). Miała ona zajmować się kwestiami prowadzonej przez Cerkiew działalności społecznej i sądownictwem kanonicznymD. Pospielovsky, The Russian Church..., s.33.. Sobór powołał do niej znanych teologów świeckich, m.in. Kudriawcewa, Titlinowa, DobronrawowaM. Maszkiewicz, Aleksandr Wwiedeński.., s.36.. Obydwa ciała, w warunkach całkowitej zgodności, mogły również złożyć z urzędu patriarchę. Równocześnie sobór przywrócił praktykę wyboru biskupów przez zgromadzenia duchowieństwa i wiernych eparchii, nie zaś poprzez ich odgórną nominacjęPierwszym biskupem wybranym w ten sposób był metropolita Piotrogrodu Beniamin (Kazanski)., chociaż musieli być wcześniej zatwierdzeni przez Wyższą Radę Kościelną. Sobór postanowił również przywrócić zasadę pozostawiania biskupów na jednej katedrze przez cały okres ich pracy duszpasterskiej, przenosząc hierarchów jedynie w wyjątkowych wypadkachD. Pospielovsky, The Russian Church..., s.34..