1941–1944 Rejon ustrzycki przestał istnieć wraz z wybuchem wojny niemiecko-radzieckiej 22 czerwca 1941. Na mocy dekretu Adolfa Hitlera z 1 sierpnia 1941 obszar dawnej gminy Czarna wszedł w skład Generalnego Gubernatorstwa i utworzonego tam nowego dystryktu Galicja, gdzie odtworzono gminę Czarna w jej oryginalnych granicach. 15 listopada 1941 gminę Czarna włączono do powiatu sanockiego w dystrykcie krakowskimDekret o zmianie granic Starostw Powiatowych i Związków Gmin w Okręgu Krakau, z dnia 3 listopada 1941 r. (Dziennik Rozporządzeń dla Generalnego Gubernatorstwa z dnia 30 listopada 1941 r., Krakau, Nr. 111, str. 659).
W 1943 roku gmina Czarna liczyła 4972 mieszkańców (2286 w Czarnej, 1084 w Paniszczowie, 521 w Rabem, 496 w Sokołowej Woli, 273 w Zadwórzu i 312 w Żołobku) Amtliches Gemeinde- und Dorfverzeichnis fuer das GG..
1944–1952 Latem 1944 przywrócono ponownie granicę na Sanie po zajęciu wschodnich terenów przez Armię Czerwoną, włączając ponownie cały obszar gminy Czarna do reaktywowanego 31 lipca 1944 rejonu ustrzyckiego w ZSRR1944 рік в історії (history.org.ua).