Motocykle późnej serii produkcyjnej, posiadające w dokumentach rejestracyjnych datę produkcji ustaloną po roku 2006, stanowią egzemplarze poprodukcyjne, pochodzące z zapasów producenta lub poszczególnych salonów sprzedaży.
Po przeprojektowaniu bliźniaczego silnika w modelu XL125V Varadero na zasilanie wtryskiem, Honda kontynuowała jego produkcję w latach 2007- 2011.
JC29 X-Y thumb|Tabliczka z numerem VIN jednego z pierwszych egzemplarzy VT125C, wyprodukowanego w marcu 1999 r. w fabryce Kumamoto w Japonii Motocykl VT 125 C Shadow był produkowany przez Hondę w fabryce Kumamoto w Japonii oraz w europejskiej fabryce Hondy Montesa w Hiszpanii. Wczesna wersja produkcyjna z lat 1999-2000 była montowana w fabryce Kumamoto. 17-cyfrowy numer VIN tych egzemplarzy motocykla rozpoczyna się od znaków "JH2" (Honda Motorcycle, Manufactured in Japan), po których występuje właściwe oznaczenie wersji "JC29". Dziesiąty znak numeru VIN oznacza rok produkcji motocykla, odpowiednio "X" - rok 1999 oraz "Y" - rok 2000. Identyfikatorem fabryki jest jedenasty symbol "K", oznaczający fabrykę Kumamoto.