Egzemplarze te posiadają literę "A" w ósmym polu numeru VIN oraz moduł zapłonowy model N51F, pozwalający na rozwinięcie prędkości maksymalnej 103 km/h.
VT 125 C2 "Deluxe" thumb|Honda VT125 C2 Shadow z charakterystycznym dla tej wersji dwubarwnym malowaniem zbiornika paliwa Od początku produkcji standardowa wersja motocykla VT 125 Shadow, oznaczona symbolem "C", była oferowana w 3 podstawowych kolorach: NH-359MR (Mute Black Metallic), NH-398M (Future Gray Metallic) oraz R-101C-U (Candy Glory Red). Rzadziej spotykane są egzemplarze malowane na kolor R-296M (Carnelian Red Metallic), R-231M (Mystery Red Metallic - wyłącznie w wersji "C2") oraz YR-217M (Elegant Beige Metallic - jedynie 860 sztuk, pochodzących z fabryki Montesa). W 2000 roku Honda wprowadziła wersję "Deluxe", w odróżnieniu od wersji standardowej oznaczoną symbolem "C2". Egzemplarze te wyróżniało charakterystyczne, dwubarwne malowanie zbiornika paliwa z wykorzystaniem kolorów NH-146M (Accurate Silver Metallic) oraz YR-142M (Pearl Beige Metallic).