Historia Gmina żydowska powstała w Mogielnicy pod koniec XVIII w.. Miasto było jednym z ważniejszych ośrodków chasydyzmuzobacz stronę Żydowskiego Instytutu Historycznego poświęconą Mogielnicy https://web.archive.org/web/20120705002205/http://www.jewishinstitute.org.pl/pl/gminy/miasto/374.html, chociaż mogielnicka synagoga prawdopodobnie była przeznaczona społeczności aszkenazyjskiejPortal The Bezalel Narkiss Index of Jewish Art: https://cja.huji.ac.il/browser.php?mode=set&id=22159. Mieszkańcy wyznania mojżeszowego stanowili w 1827 prawie połowę ludności miejscowości. Nieistniejący budynek bożnicy został wzniesiony po 1856, kiedy to przez społeczność żydowską Mogielnicy został zakupiony drewniany dom, mający pełnić funkcję modlitewną. Synagoga musiała zostać wybudowana w późniejszym okresie.
W czasie I wojny światowej budynek został znacznie uszkodzony. Prace restauracyjne przeprowadzono po 1921 wg projektu architekta Henryka Stiefelmana, jednocześnie przebudowując wnętrza obiektu. We wrześniu 1939 synagoga została spalona przez Niemców i nie została odbudowana.