W pojedynczych przypadkach donoszono o wystąpieniu: hepatotoksyczności, która najprawdopodobniej spowodowana jest silną reakcją alergiczną na marawirok zespołu reaktywacji immunologicznej martwicy kości

Istnieją obawy co do długoterminowych skutków blokowania receptora CCR5, gdyż jego funkcja u osób zdrowych nie jest w pełni poznana.

Dawkowanie Marawirok podaje się dwa razy dziennie w standardowej dawce 300 mg. Dawkę tę należy zmniejszyć do 150 mg w przypadku jednoczesnego stosowania leków będących silnymi inhibitorami izoenzymu CYP3A4. Zwiększenie dawki do 600 mg następuje w przypadku jednoczesnego zażywania silnych induktorów CYP3A4. Nie ma konieczności modyfikacji dawki przy niewydolności nerek, niemniej jednak: podczas jednoczesnego przyjmowania preparatu sakwinawir + rytonawir należy wydłużyć odstęp między kolejnymi dawkami leki, w zależności od stopnia upośledzenia pracy nerek, zgodnie z następującym schematem: odstęp 24-godzinny, gdy klirens kreatyniny wynosi 50–80 ml/min odstęp 48-godzinny, gdy klirens kreatyniny wynosi <30–50 ml/min