Powołany był także na Copa América 1999, gdzie wystąpił w trzech spotkaniach fazy grupowej z Peru, Paragwajem i Boliwią. Podczas Pucharu Azji 2000 zagrał w 6 spotkaniach turnieju, w których zdobył 3 bramki (dwie przeciwko Irakowi i jedną przeciwko Arabii Saudyjskiej). Turniej ten zakończył się zwycięstwem Japonii. Po raz ostatni w reprezentacji Japonii zagrał 25 kwietnia 2001 w meczu przeciwko Hiszpanii, przegranym 0:1. Łącznie Hiroshi Nanami w latach 1995–2001 wystąpił w 67 spotkaniach, w których strzelił 9 bramek.
Mecze i gole w reprezentacji#DataMiastoPrzeciwnikGolWynikRozgrywki1.06.08.1995Kioto3:0towarzyski2.24.10.1995Tokio2:1towarzyski3.10.02.1996Wollongong4:1towarzyski4.14.02.1996Melbourne0:3towarzyski5.19.02.1996Hongkong5:0towarzyski6.22.02.1996Hongkong1:1towarzyski7.26.05.1996Tokio1:0towarzyski8.29.05.1996Fukuoka3:2towarzyski9.25.08.1996Osaka5:3towarzyski10.11.09.1996Tokio1:0towarzyski11.13.10.1996Kobe1:0towarzyski12.06.12.1996Al-Ajn2:1Puchar Azji 199613.09.12.1996Al-Ajn4:0Puchar Azji 199614.12.12.1996Al-Ajn1:0Puchar Azji 199615.15.12.1996Al-Ajn0:2Puchar Azji 199616.09.02.1997Bangkok1:1Puchar Króla Tajlandii17.13.02.1997Bangkok0:1Puchar Króla Tajlandii18.15.03.1997Bangkok1:3towarzyski19.23.03.1997Maskat1:0El. MŚ 199820.25.03.1997Maskat10:0El. MŚ 199821.27.03.1997Maskat6:0El.