26 lutego 2016 roku został wybrany nowym przewodniczącym FIFA (do 2026) zdobywając 115 głosów w drugiej turze. Pokonał członka rodziny królewskiej Bahrajnu – szejka Salmana Bin Ibrahima Al Khalifę (88 głosów), księcia Jordanii – Alego ibn Husajna (4 głosy) oraz Francuza Jérôme’a Champagne’a (0 głosów) [data dostępu: 2016-02-26] .. Z powodu posiadania również obywatelstwa włoskiego został pierwszym Włochem wybranym na to stanowisko.
Prawa kobiet Po rewolucji islamskiej w 1979 roku w Iranie, zabroniono kobietom wstępu na stadiony podczas meczów męskich drużynWatch: Iranian women attend first football match in 40 years [data dostępu: 2019-10-11] .. Infantino wielokrotnie ostrzegał Związek Piłki Nożnej Islamskiej Republiki Iranu oraz władze Iranu o prawach kobiet w tym krajuهشدار دوباره فیفا به ایران: به زنان باید اجازه حضور در ورزشگاه داده شود [data dostępu: 2019-09-19] .. 8 września 2019 roku Sahar Khodayari dokonała samopodpalenia po tym, jak została aresztowana za próbę wejścia na Stadion Azadi w Teheranie. Zmarła dzień później, 9 września 2019 roku w wyniku odniesionych poparzeńFifa ‘assured’ Iranian women will be able to attend football matches [data dostępu: 2019-09-22] ..