We wrześniu 1993 roku komitet został uznany przez Międzynarodowy Komitet Olimpijski.
Reprezentacja Słowacji zadebiutowała w igrzyskach olimpijskich w 1994 roku, podczas zimowych igrzysk w Lillehammer. Wówczas w kadrze znalazło się 42 sportowców, którzy nie zdobyli jednak żadnego medalu. Pierwsze medale olimpijskie dla Słowacji zdobyli podczas Letnich Igrzysk Olimpijskich 1996 w Atlancie kajakarze Michal Martikán i Slavomír Kňazovický oraz strzelec Jozef Gönci.
Pierwszym słowackim medalistą zimowych igrzysk olimpijskich został podczas igrzysk w Turynie w 2006 roku snowboardzista Radoslav Židek, który zdobył srebrny medal w snowcrossie. Był to do 2010 roku jedyny medal zimowych igrzysk zdobyty dla Słowacji.
Do 1992 roku Słowacy występowali w igrzyskach olimpijskich w reprezentacji Czechosłowacji.
Występy na mistrzostwach świata w sezonie przedolimpijskim thumb|Anastasija Kuźmina – wicemistrzyni świata w biathlonie z 2009 roku W lutym 2009 roku rozegrane zostały biathlonowe mistrzostwa świata w Pjongczangu. Na tych mistrzostwach srebrny medal w biegu masowym zdobyła Anastasija Kuźmina, zajęła również siódme miejsce w sprincie.