Położył nacisk na inwestycje, powstało wiele nowych sal dydaktycznych i centralne laboratorium komputerowe. W 1999 r. oddano do użytku Audytorium Novum, nowoczesne centrum dydaktyczno-konferencyjne, które przez kilka lat służyło również za salę koncertową Polskiej Filharmonii Bałtyckiej. Audytorium Novum było pierwszą od 20 lat dużą inwestycją budowlaną na Politechnice Gdańskiej. W 2002 r. zakończona została budowa gmachu Wydziału Zarządzania i Ekonomii. Prof. Kołodziejczyk zainicjował też wymianę dachów kilku uczelnianych budynków, w tym Gmachu Głównego (1 ha powierzchni), przeprowadził generalny remont większości domów studenckich, w Brzeźnie wybudowano nowy akademik. Z jego inicjatywy rozpoczęto prace przygotowawcze do budowy nowego gmachu dla Wydziału Elektroniki, Telekomunikacji i Informatyki oraz przebudowy dziedzińców w Gmachu Głównym.
Jego zasługą jest rozkwit życia kulturalnego na uczelni. Skupił się przede wszystkim na organizowaniu koncertów. Politechnika Gdańska od końca lat 90. XX wieku organizuje ponad 20 cyklicznych koncertów rocznie.