15 lipca 1945 klasztor czerniakowski wraz z kościołem został zwrócony bernardynom, zaś siedziba Parafii św. Bonifacego, zarządzonej nadal przez Zmartwychwstańców, została przeniesiona 16 września 1945 do wybudowanego zgodnie z umową kościoła św. Kazimierza.
W marcu 1950 przeprowadzono reorganizację struktury parafialnej na obszarze Sielc i Czerniakowa. Dekretami arcybiskupa Stefana Wyszyńskiego z 11 marca 1950, które weszły w życie 19 marca, na Sielcach utworzono nową Parafię św. Kazimierza pod zarządem Zmartwychwstańców z siedzibą kościele św. Kazimierza, a okrojoną Parafię św. Bonifacego przekazano bernardynom i przeniesiono jej siedzibę ponownie do klasztoru czerniakowskiego. Dekretem z 25 marca 1950, który wszedł w życie 2 kwietnia, z parafii wyłączono również południową jej część, obejmującą Sadybę, i na obszarze tym utworzono nową Parafię św. Tadeusza Apostoła.
Kościół parafialny Kościół św. Antoniego z Padwy został wybudowany w XVII wieku, budowę nowego kościoła św. Jana z Dukli zakończono w 2000.