W 1970 przeszedł na rentę inwalidzką z powodu zawodowej choroby nóg, lecz nie zaprzestał intensywnych działań twórczych. Kilka lat później zapadł na chorobę nowotworową płuc. Umarł w Warszawie. Ciało zostało sprowadzone do Łowicza, gdzie w obecności przedstawicieli władz miasta, organizacji społecznych i kościelnych, po mszy żałobnej w Kolegiacie Łowickiej zostało z honorami pochowane na Cmentarzu Katedralnym.
W roku 2021, w 45-lecie jego śmierci, Rada Miejska w Łowiczu przyznała Zdzisławowi Pągowskiemu pośmiertnie tytuł "Zasłużony dla Miasta Łowicza", a pod Basztą Gen. Klickiego w Łowiczu otwarto instalację o kształcie sztalugi, upamiętniającą artystę."Nadanie tytułu Zasłużony dla Miasta Łowicza", lowiczanin.info, https://lowiczanin.info/pl/14_kultura/290903_nadanie-tytulu-zasluzony-dla-miasta-lowicza.html"Zdzisław Pągowski pośmiertnie uhonorowany tytułem Zasłużony dla Miasta Łowicza", Oficjalny Portal Miejski - https://www.lowicz.eu/pl/index.php?id=32&idd=5715"Zdzisław Pągowski Zasłużony dla Miasta Łowicza", PTTK Oddział w Łowiczu, http://pttklowicz.pl/2021/11/25/zdzislaw-pagowski-zasluzony-dla-miasta-lowicza/