Japonia na Mistrzostwach Świata w Lekkoatletyce 2009 – reprezentacja Japonii podczas czempionatu w Berlinie liczyła 57 zawodników. Sportowcy z Kraju Kwitnącej Wiśni zdobyli 2 medale: srebrny w maratonie kobiet oraz brązowy w męskim rzucie oszczepem.
Medale Yoshimi Ozaki – 18px|Srebro srebrny medal w biegu maratońskim Yukifumi Murakami – 18px|Brąz brązowy medal w rzucie oszczepem
Występy reprezentantów Japonii Mężczyźni Konkurencje biegowe KonkurencjaZawodnikEliminacjeĆwierćfinałPółfinałFinałRezultatPoz.RezultatPoz.RezultatPoz.RezultatPoz.100 mMasashi Eriguchi10.38310.458nie awansowałShintaro Kimura10.47310.548nie awansowałNaoki Tsukahara10.28210.15310.258nie awansował 200 mShinji Takahira20.86220.694nie awansowałHitoshi Saitō21.386nie awansował Kenji Fujimitsu20.69320.976nie awansował400 mYuzo Kanemaru46.834—nie awansowałHideyuki Hirose46.807—nie awansował5000 mYuichiro Ueno14:30.7616—nie awansował10 000 mYuki Iwai—29:24.1225110 m ppłTasuku Tanonaka13.847—nie awansował400 m ppłKenji Narisako49.605—nie awansowałKazuaki Yoshida49.45 PB3—50.348nie awansował3000 m z przeszkodamiYoshitaka Iwamizu8:39.038—nie awansował4x100 mMasashi EriguchiNaoki TsukaharaShinji TakahiraKenji Fujimitsu38.532—38.304MaratonSatoshi Irifune—2:14:5414Masaya Shimizu—2:14:0611Kazuhiro Maeda—2:19:5939Arata Fujiwara—2:31:0661Atsushi