Historia Kompania Zatoki Hudsona w 1838 roku otworzyła faktorię handlową na południe od dzisiejszej osady i działała w latach 1838–1842, 1876–1915 oraz 1923–1932. Jednakże okoliczni Inuici nigdy nie osiedlili się przy faktorii. Latem żyli na wybrzeżu zatoki a zimą przenosili obóz 50 km w głąb lądu. W 1959 roku lokalni Inuici z własnej inicjatywy założyli pierwszą spółdzielnię w północnym Quebecu w celu organizacji handlu golcami zwyczajnymi. Budowa osady rozpoczęła się w 1962 roku i od tego też roku Inuici zaczynają porzucać nomadyczne tryb życia na rzecz życia w wiosce. W 1963 roku otwarto szkołę, budynki rządowe i sklep spółdzielczy. W 1980 roku Kangiqsualujjuag zostało zalegalizowane jako gmina.
Wczesnym rankiem 1 stycznia 1999 roku, podczas świętowania nowego roku na salę gimnastyczną szkoły Satuumavik zeszła lawina zabijając 9 osób. 25 innych osób zostało rannych, z czego 12 na tyle poważnie, że zostali przetransportowani drogą lotniczą 1500 km na południe, do szpitala w Montrealu. Pojawiły się głosy, że huczna zabawa mogła być jedną z przyczyn, które wyzwoliły lawinę.