Kolejna reedycja gry ukazała się na konsolę Sony PlayStation w 2002 roku w Japonii. W Europie Zachodniej i Polsce, gra ukazała się w marcu 2003 roku i została nazwana Final Fantasy Origins (w zestawie sprzedawana razem z Final Fantasy 2) i było to premierowe wydanie (poprzednie wersje nigdy się nie ukazały w tym regionie). Oprócz ulepszonej grafiki podobnej do tej z wersji na WonderSwan Color, zmieniony został również system gry, a także wprowadzona została pseudo-trójwymiarowa mapa świata i wstawki FMV.
Największa zmiana została zauważona w wersji na Game Boy Advance wydanej w 2004 roku, jako część kolekcji Finest Fantasy For Advance. Do gry został dodany tryb Soul of Chaos, który pozwolił graczom na walkę z bossami z przyszłych gier z serii Final Fantasy. Są to m.in. Gilgamesh, Atomos, Omega, Shinryu, Ultros, Phantom Train i Death Gaze.
Bohaterowie Główni bohaterowie Bohaterowie Final Fantasy są anonimowi. Gracz na początku przygody otrzymuje w swojej drużynie cztery postaci, którym musi nadać imiona oraz określić ich klasy, których do wyboru ma sześć. Każda klasa po wykonaniu zadania dla Bahamuta, Króla Smoków przemienia się w klasę prestiżową. W grze nie ma ograniczenia co do liczby postaci tej samej klasy w drużynie.