W 1536 król Chrystian III wprowadził w Danii luteranizm. W Ribe rozpoczął działalność uczeń Lutra Hans Tavsen, który w latach 1542-1561 był biskupem Ribe i głównym pastorem miasta. Przyczynił się on też do przebudowy katedry. Usunięto z niej ołtarze boczne oraz wcześniejszy, bogaty wystrój, który przeszedł na własność monarchy, podobnie jak zsekularyzowane dobra kościoła katolickiego. Do czasów współczesnych ostały się jedynie: rzeźba „Grupa św. Jurgena”, chrzcielnica z brązu, lichtarz oraz nagrobek ostatniego katolickiego biskupa Ribe, Ivara Muncha.
Kolejna przebudowa świątyni miała miejsce za króla Chrystiana IV (1588-1648). Na ołtarzu pojawiła się renesansowa nastawa a w kościele – nowe organy, ambona i nowe malowidła.
Katedra była kompleksowo odrestaurowana w latach 1882-1904 pod nadzorem architekta H.C. Amberga. Podczas restauracji odbudowano z użyciem oryginalnych materiałów południową, romańską wieżę fasady zachodniej (tzw. Mariatårnet, – wieżę Mariacką), która została zburzona w XVIII w. Wiszą w niej obecnie dzwony katedralne.
Architektura Katedra w Ribe jest świątynią trzynawową a jeśli liczyć zewnętrzne kaplice z obu stron – to pięcionawową. Jest ona długa na 61,5 m (w tym prezbiterium 20,4 m) i szeroka na 33,5 m (włącznie z transeptem).