Kompozycja Utwór zawiera w połowie elementy z europopu, a w połowie elementy disco. „Alejandro” inspirowane jest piosenkami zespołu ABBA i Ace of BaseLady Gaga: The Fame Monster. Music Review – Slant Magazine. Inspiracje z Ace of Base widoczne są w beacie, śpiewie, melodii i w innym niż angielski akcencie, a słowa piosenki są niewyraźne. Utwór zawiera fragment widowiska skrzypcowego „Csárdás” włoskiego kompozytora Vittorio Montiego. Kompozycję otwiera skrzypcowy płacz, zasmucona Gaga śpiewa: „Wiem, że jesteśmy młodzi i wiem, że możesz mnie kochać / Ale ja nie mogę być z tobą dłużej, Alejandro”. Utwór następnie zmienia beat na europop, Gaga żegnając kochanków śpiewa: „Wiesz, że Cię kocham / Gorący, jak Meksyk, raduj się! / W tym momencie muszę wybrać / Nic do stracenia”. Do końca utworu wymienia trzech bohaterów: Alejandro, Fernando, Roberto.
Zgodnie z nutami opublikowanymi na Musicnotes.com przez Sony/ATV Music Publishing piosenka jest umieszczona w znaku metrycznym taktu na cztery o umiarkowanym tempie, z 99 uderzeniami na minutę. Utwór składa się w tonacji h-moll z wokalem Gagi w zakresie sięgającym od F3 do G5. Werset piosenki ma podstawową sekwencję Bm–D–F♯m–Bm–D–F♯m jako rozwój akordów.