L.p.GospodarzewynikGościeWidzów 11 Brentford 1:0 Walsall 2,611 12 Carlisle United 3:1 Norwich City 3,946 13 Accrington Stanley 2:2 Barnet 1,501 powtórka Barnet 0:1 Accrington Stanley 1,288 14 Oxford United 1:1 Barrow 6,082 powtórka Barrow 3:1 Oxford United 2,754 15 AFC Bournemouth 1:2 Notts County 6,082 16 Stockport County 0:4 Torquay United 1,690 17 Cambridge United 1:2 York City 3,505 18 Bath City 1:2 Forest Green Rovers 3,325 19 Port Vale 0:1 Huddersfield Town 5,311 20 Staines Town 1:1 Millwall 2,753 powtórka Millwall 4:0 Staines Town 3,452
† – po dogrywce
Trzecia Runda Losowanie odbyło się 29 listopada 2009 na stadionie Wembley. W tej rundzie do rozgrywek dołączyły drużyny z najwyższych szczebli rozgrywek w Anglii czyli z Premier League oraz Football League Championship. Oprócz nich w losowaniu uczestniczyli zwycięzcy z poprzedniej rundy. Większość meczów odbyła się 2 i 3 stycznia 2010, aczkolwiek niektóre z nich musiały zostać przełożone ze względu na opady śniegu. Barrow, Forest Green Rovers, Luton Town oraz York City z Conference National (5 poziom ligowy) były jedynymi drużynami spoza oficjalnych lig zawodowych, pozostałymi na tym poziomie rozgrywek, jednakże żadnej z nich nie udało się awansować do następnej fazy rozgrywek.