Gdańskie Wydawnictwo Oświatowe realizuje również projekty interaktywne, w skład których wchodzą kursy internetowe (Matematura.pl, Matlandia, Gimplus), internetowe mapy historyczne (Historyczna Mapa Polski oraz Mapa Imperium Rzymskiego), jak i aplikacje online, wspierające pracę nauczycieli (Kompozytor klasówek).
Projekty edukacyjne Wydawnictwo zainicjowało w 2002 roku projekt edukacyjny Lepsza Szkoła obejmujący nauczycieli matematyki, języka polskiego, historii, fizyki i biologii. Jego główne cele to badanie efektywności nauczania, rozwijanie integracji międzyprzedmiotowej oraz kształcenie nauczycieli. Także projekt Interaktywna matematyka mający na celu podwyższenie poziomu nauczania matematyki w gimnazjach z powiatu kartuskiego przez upowszechnienie nowoczesnych metod nauczania matematyki z zastosowaniem innowacyjnych narzędzi multimedialnych – tablic interaktywnych. Projekt zakładał, że dzięki wykorzystaniu nowoczesnych technologii uda się skupić uwagę uczniów, zwiększając ich motywację, zaangażowanie w tok zajęć, a tym samym – efektywność nauki. Kolejnym projektem była pomoc w rozwoju Akademii 30+ założonej przez Gdańską Fundację Rozwoju oraz Fundację dla Uniwersytetu Jagiellońskiego. Akademia 30+ to projekt typu non-profit, działający w Krakowie, Częstochowie oraz w Trójmieście.