Rozwój portu morskiego w Koprze po 1957 roku spowodował potrzebę budowy normalnotorowego połączenia z jugosłowiańską siecią kolejową. Linię prowadzącą przez Prešnicę do Divačy otwarto w grudniu 1967 roku, lecz początkowo docierała ona wyłącznie do stacji towarowej i terenów portowych. Połączenie służyło przede wszystkim przewozowi ładunków między portem a zapleczem Słowenii i pozostałymi częściami Jugosławii.
Obecną stację pasażerską otwarto 25 maja 1979 roku po wybudowaniu odgałęzienia o długości około 2,4 km od istniejącej linii portowej. Uruchomienie dworca umożliwiło bezpośrednią obsługę pasażerską Kopru i oddzieliło ruch podróżnych od rozbudowanej infrastruktury towarowej portu.
W latach 80. XX wieku do Kopru kursowały pociągi dalekobieżne z głębi Jugosławii, a stacja pełniła funkcję jednego z kolejowych punktów dojazdu nad północny Adriatyk. Rozkład jazdy z lat 1981–1982 przewidywał między innymi bezpośrednie połączenia z Lublaną oraz pociągi umożliwiające dojazd z innych części państwa na słoweńskie wybrzeże.
Infrastruktura Stacja jest obiektem końcowym, na którym tory pasażerskie zakończone są kozłami oporowymi. Posiada trzy perony i cztery krawędzie peronowe.