W 1891 szantażowała rodzinę, że nie da błogosławieństwa wychodzącej za mąż za Józefa Unierzyskiego córce Helenie, jeżeli nie zostanie uwolniona spod dozoru sądowego. Jan Matejko ostatecznie przyjął warunki TeodoryM. Szypowska, Jan Matejko wszystkim znany, Warszawa 1988, s. 382–383..
Ostatnie lata We wrześniu 1892 odbył się ślub młodszej córki Teodory, Beaty z Wincentym Kirchmayerem, pochodzącym z bogatej rodziny krakowskiej. Podobnie jak przy ślubie Heleny, nie obyło się bez przykrych starć z Matejkową, która odmówiła udzielenia błogosławieństwa młodej parze i spóźniła się na ceremonię zaślubinM. Szypowska, Jan Matejko wszystkim znany, Warszawa 1988, s. 387.. 1 listopada 1893 w wyniku krwotoku wewnętrznego Jan Matejko zmarł. Teodora była obecna przy jego śmierci, którą bardzo ciężko przeżyła. Matejko został pochowany 5 listopada 1893 na cmentarzu Rakowickim w KrakowieM. Szypowska, Jan Matejko wszystkim znany, Warszawa 1988, s. 427.. W kwietniu 1896 Teodora przebywała na kuracji u doktora Gwiazdomorskiego, zaś w sierpniu przyjechała z wizytą do Serafińskich na Koryznówkę. Była już wówczas ciężko chora na cukrzycę, która utrudniała jej chodzenie. Wkrótce musiała wrócić do Krakowa na polecenie lekarza prowadzącego kurację. Teodora zmarła dwa dni po powrocie do domu i została pochowana obok męża na cmentarzu RakowickimS.