W kolejnych dwóch sezonach odstąpiono od zasady do dwóch wygranych w przypadku play-off oraz od gry systemem kołowym w grupie walczącej o utrzymanie. Druga faza rozgrywek w obu połowach tabeli była zatem rozgrywana systemem pucharowym w formie dwumeczu. Czołowe cztery drużyny rozgrywały spotkania o mistrzostwo kraju (play-off), natomiast zespoły z dolnej połowy tabeli o utrzymanie w najwyższej klasie rozgrywkowej (play-out). Zwycięzcy półfinałów play-off zmierzyli się w meczach o mistrzostwo kraju, przegrani zaś o brązowy medal. Zwycięzcy półfinałów play-out zagrali ze sobą o piąte miejsce w rozgrywkach, natomiast przegrani z tych pojedynków w barażach o utrzymanie w Ekstralidze z dwoma najlepszymi zespołami I ligi. Drugie spotkanie w ramach tych dwumeczów odbywało się na stadionie drużyny sklasyfikowanej wyżej po fazie grupowej.
Sezon 2008 został rozegrany od sierpnia do listopada tego roku. Dziesięć drużyn rozegrało każda z każdą po jednym meczu, po czym nastąpiła faza pucharowa.
W 2009 roku nie przyznano tytułu mistrza Czech, powrócono natomiast do systemu jesień-wiosna w sezonie 2009/2010.