stopniowo zaszły zmiany w profilu działalności PTP: z jednej strony dotychczasowy zasięg aktywności towarzystwa ograniczony głównie do ziem polskich zaboru austriackiego rozszerzono na cały kraj, z drugiej stopniowo zaczął się zmniejszać naukowy charakter towarzystwa na rzecz popularyzacji nauk przyrodniczych wśród społeczeństwa. Trend ten utrzymał się także po 1945 r.
Obecnie siedziba Zarządu znajduje się w Krakowie przy ulicy Podwale 1 lok. 2.
Zgodnie ze Statutem, celami Towarzystwa są: upowszechnianie i pielęgnowanie nauk przyrodniczych, poznawanie i ochrona przyrody ojczystej; propagowanie etycznych i humanistycznych wartości przyrody; prowadzenie i popieranie prac badawczych nad teoretycznymi podstawami ochrony przyrody; finansowe i naukowe wspieranie prac nad restytucją gatunków wymierających prowadzenie i popieranie prac nad przygotowaniem i aktualizacją sieci obszarów chronionych prowadzenie i popieranie badań nad metodami gospodarowania na obszarach chronionych i restytucją biocenoz na terenach zdegradowanych oraz wprowadzanie wyników tych badań do praktyki prowadzenie szeroko rozumianej edukacji przyrodniczej i badań nad jej problematyką organizowanie krajowych i zagranicznych sympozjów przyrodniczych współpraca międzynarodowa w zakresie ochrony przyrody, w tym szczególnie w obszarach