Współczesna eparchia włodzimiersko-wołyńska została powołana do istnienia decyzją Świętego Synodu Ukraińskiego Kościoła Prawosławnego Patriarchatu Moskiewskiego z 3 maja 1996. Jej pierwszym zwierzchnikiem został biskup Symeon (Szostacki), który otrzymał tytuł biskupa włodzimiersko-wołyńskiego i kowelskiego. Eparchia włodzimiersko-wołyńska została wydzielona z eparchii wołyńskiej ze stolicą w Łucku. W momencie swojego powstania obejmowała 167 parafii, w których służyło 148 duchownych, oraz dwa monastery: monaster św. Mikołaja w Mielcach (męski) oraz monaster Zaśnięcia Matki Bożej w Zimnem (żeński).
Podział administracyjny Według danych z 2010 eparchia dzieliła się na 12 dekanatówБлагочиння: dekanat włodzimiersko-wołyński dekanat hirnikowski dekanat kowelski miejski dekanat kowelski – Zmartwychwstania PańskiegoNazwa dekanatu pochodzi od jednej z cerkwi w Kowlu. dekanat kowelski – Trójcy Świętej dekanat kowelski – Wprowadzenia do Świątyni dekanat iwanyczowski dekanat krymneński dekanat lubomelski dekanat nowowołyński dekanat ratnowski dekanat starowyski dekanat turijski dekanat szacki
Eparchia liczy łącznie 235 parafii, w których służy 220 kapłanów.