Decyzję o wstąpieniu do stanu duchownego Boris Puszkar podjął w 1988, po odbyciu pielgrzymki do Ziemi Świętej. W tym samym roku został wyświęcony kolejno na diakona i kapłana. W 1992 otrzymał godność protojereja. W tym samym roku, 12 sierpnia, otrzymał nominację na biskupa władywostockiego i nadmorskiego. W związku z tym 13 września 1992 złożył wieczyste śluby zakonne, przyjmując imię Beniamin na cześć metropolity piotrogrodzkiego i nowomęczennika Beniamina (Kazanskiego). Tydzień później otrzymał godność archimandryty. Dzień później w soborze Objawienia Pańskiego w Moskwie miała miejsce jego chirotonia na biskupa władywostockiego i nadmorskiego, w której jako konsekratorzy wzięli udział patriarcha moskiewski i całej Rusi Aleksy II, metropolita kruticki i kołomieński Juwenaliusz, metropolita wołokołamski i juriewski Pitirim, arcybiskup solnecznogorski Sergiusz, biskup istriński Arseniusz, biskup dmitrowski Filaret oraz biskup podolski Wiktor.
W 2003 podniesiony do godności arcybiskupiejНовейшая история. Zaliczany do konserwatywnego skrzydła w hierarchii Rosyjskiego Kościoła PrawosławnegoO. Nadskakuła, Uprzedzenia między Polakami i Rosjanami.