Markus Ebner (ur. 9 listopada 1970 w Ingolstadt) – niemiecki snowboardzista, dwukrotny medalista mistrzostw świata.
Kariera Po raz pierwszy na arenie międzynarodowej pojawił się 10 lutego 1996 roku w Lenggries, gdzie w zawodach FIS Race zajął trzecie miejsce w gigancie. Nigdy nie wystartował na mistrzostwach świata juniorów.
W Pucharze Świata zadebiutował 28 listopada 1996 roku w Tignes, gdzie zajął 14. miejsce w slalomie równoległym (PSL). Tym samym już w swoim debiucie wywalczył pierwsze pucharowe punkty. Na podium zawodów pucharowych po raz pierwszy stanął 6 stycznia 1999 roku w Morzine, wygrywając rywalizację w gigancie równoległym (PGS). W zawodach tych wyprzedził Francuza Mathieu Bozzetto i Richarda Richardssona ze Szwecji. Łącznie 13 razy stawał na podium zawodów PŚ, odnosząc przy tym jeszcze dwa zwycięstwa: 31 stycznia 2001 roku w Bad Gastein i 6 grudnia 2002 roku w Tandådalen wygrywał w PSL. Najlepsze wyniki osiągnął w sezonie 2002/2003, kiedy to zajął drugie miejsce w klasyfikacji generalnej, a w klasyfikacji PARKlasyfikacja łączna slalomu równoległego i giganta równoległego był trzeci. Ponadto w sezonie 2001/2002 był drugi w klasyfikacji giganta.