Razem z mężem Franciszkiem I Lotaryńskim, którego w Niemczech wybrano na cesarza rzymskiego, stali się założycielami nowej Dynastii Habsbursko-Lotaryńskiej. Panowała ona w Austrii, Czechach i na Węgrzech aż do 1918.
Ziemie Monarchii Habsburgów thumb|350px|Tereny pod panowaniem Habsburgów w 1547 Granice ziem należących do austriackich Habsburgów zmieniały się nad wyraz często. Na przestrzeni dziejów do ziem tych należą ziemie dziedziczne Habsburgów: Arcyksięstwo Austriackie, Księstwo Karyntii, Księstwo Styrii, Księstwo Krainy, Gorycja i Gradiyska, Triest oraz rozliczne ziemie w Szwabii i Alzacji (tzw. Austria Przednia) itd. kraje Korony św. Wacława, w skład których wchodziło: Królestwo Czech, Margrabstwo Moraw, margrabstwo Dolnych i Górnych Łużyc (do 1635) Śląsk (w większości utracony w latach 1740–1742). kraje Korony św. Stefana, w skład których wchodzi: zachodnia część Królewskich Węgier (do której przyłączono część środkową – tzw. Osmańskie Węgry – w 1699 roku), Księstwo Siedmiogrodu (od 1699;