Według producenta nowsze odmiany FlyEye są również w pełni zintegrowane z TOPAZ, PERAD, U-GATE i systemem ATAK, co pozwala wykorzystywać bezzałogowiec jako retransmiter łączności oraz używać smartfonów jako terminali graficznych.

FlyEye opisywano także jako element systemów rozpoznawczo-uderzeniowych GRUPY WB. Według Defence24 amunicja krążąca Warmate wraz z FlyEye, systemem komunikacji FONET i systemem zarządzania TOPAZ Strike tworzą system rozpoznawczo-uderzeniowy SWARM. Z kolei według materiałów producenta w systemie SWARM GRUPA WB zapewnia pełną integrację systemów FONET, FLYEYE, WARMATE oraz łączności radiowej; FlyEye pełni w nim rolę platformy obserwacyjnej służącej do identyfikacji i lokalizacji celów, a WARMATE wykonuje zadanie ogniowe na celach wykrytych przy użyciu FlyEye.

Według PAP oraz materiałów producenta system może być dostarczany w konfiguracjach obserwacyjnej, retransmisyjnej i transportowej. Producent wskazuje także możliwość integracji FlyEye z bardzo lekkim uzbrojeniem precyzyjnym oraz z wektorowym systemem akustycznym do wykrywania źródeł wystrzału.