Ze stanowiska trenera zrezygnował w grudniu 2014 po słabszym sezonie w wykonaniu jego podopiecznych. Ogółem szkoleniowcem Leónu pozostawał przez trzy lata – oprócz zdobycia dwóch mistrzostw Meksyku dwukrotnie wziął udział w Copa Libertadores (2013 – runda wstępna, 2014 – 1/8 finału); sporym sukcesem na arenie międzynarodowej było dwukrotne pokonanie brazylijskiego giganta CR Flamengo podczas Copa Libertadores 2014 (w tym wyjazdowe zwycięstwo 3:2 na Maracanie). Jego drużyna była często chwalona za ofensywny styl gry, a oprócz tego wypromowała do reprezentacji Meksyku nieznanych dotąd szerzej zawodników takich jak Edwin Hernández, José Juan Vázquez, Luis Montes czy Carlos Peña. Skład Leónu uzupełniali natomiast uznani gracze o dużej renomie, między innymi Rafael Márquez czy argentyński napastnik Mauro Boselli. Sam Matosas jest uznawany za jednego z najwybitniejszych szkoleniowców w historii klubu.