– manga napisana przez Nisio Isina i zilustrowana przez Akirę Akatsukiego. Seria opowiada o zarządzaniu Samorządem Szkolnym przez Medaka Kurokami i Zenkichiego Hitoyoshi, których celem jest rozwiązywanie w miarę możliwości problemów uczniów szkoły. Medaka postanawia umieścić w szkole tytułową skrzynkę, do której uczniowie mogą wrzucać swoje prośby.
Medaka Box jest mangą wydawaną w odcinkach w magazynie Shūkan Shōnen Jump przez wydawnictwo Shueisha od maja 2009 roku. W lipcu wydawnictwo postanowiło wydać pierwsze 6 tomów z odcinków wydanych już w magazynie.
Fabuła Medaka Kurokami została wybrana na przewodniczącą Rady Studentów Akademii Hakoniwa i od razu postanowiła, iż ma zamiar pomóc wszystkim studentom w szkole. Wraz z Zenkichim Hitoyoshi zbiera sugestie poszczególnych studentów i rozpoczyna długą pracę, podczas której rozwiązuje problemy tak banalne jak sprzątanie klubowego pomieszczenia, poprzez poszukiwania zaginionych psów aż do pomocy w ustaleniu osobowości. Podczas trwania serii Kouki Akune i Mogana Kikaijima dołączają do Rady Studentów, aby pomóc bohaterom w rozwiązywaniu problemów.