HMS jest trzecią najstarszą szkołą medyczną w Stanach Zjednoczonych. Została założona 19 września 1782 przez Johna Warerena, Benjamina Waterhouse i Aarona Dextera. Pierwsze wykłady zostały poprowadzone w piwnicy Ratusza w Harvardzie, a następnie w Kaplicy Holdena. Uroczyste odebranie dyplomów pierwszego rocznika, złożonego zaledwie z dwóch osób, odbyło się w 1788. Laureaci Nagrody Nobla związani ze szkołą Piętnastu badaczy pracujących na Harvard Medical School jest laureatami Nagrody Nobla. W sumie, za pracę w laboratoriach Harvard Medical School zdobyli 9 nagród Nobla (8 z fizjologii lub medycyny, oraz 1 Pokojową Nagrodę Nobla). Byli to: George Minot William Murphy – (Fizjologia lub Medycyna, 1934), za odkrycia związane z leczeniem wątroby w przypadkach anemii Fritz Lipmann – (Fizjologia lub Medycyna, 1953) za odkrycie koenzymu A i jego pośredniczącej roli w metabolizmie John Enders, Frederick Chapman Robbins* oraz Thomas Huckle Weller – (Fizjologia lub Medycyna, 1954) za odkrycie zdolności wirusa polio do wzrostu w kulturach różnych typów tkanek Baruj Benacerraf – (Fizjologia lub Medycyna, 1980) za ich odkrycia dotyczące determinowanych genetycznie struktur na powierzchni komórek, które regulują odpowiedzi immunologiczne David H.