Muzeum 200px|left|thumb|Ewangeliarz ze zbiorów muzeum w monasterze Pierwszym dyrektorem muzeum założonym w monasterze został Aleksandr Chołmowski. Pierwsza stała wystawa poświęcona rozwojowi osadnictwa w regionie wołogodzkim oraz dziejom klasztoru powstała pięć lat po powstaniu placówki. Początkowo było to muzeum historyczno-artystyczneAbout museum.. W latach 30. XX wieku, pod naciskiem władz lokalnych, muzeum zmieniło swój charakter; jego wystawy zostały podporządkowane panującej ideologii i przedstawiały monaster jako instytucję uciskającą miejscowych chłopów. Od 1937 otwarto w nim dział przyrodniczy, zaś w 1938 – wystawę o charakterze antyreligijnym. Ponadto w latach 30. władze zarekwirowały muzeum część cennych eksponatów, w wielu przypadkach przekazując je do innych placówek wystawienniczych. Przez część okresu II wojny światowej obiekt został przejęty na cele wojskowe.
Od lat 50. i 60. XX wieku w monasterze trwały prace konserwatorskie.
Według oficjalnej strony muzeum jest ono rocznie odwiedzane przez 260 tys.