W 1398 r. król Wacław IV Luksemburski podarował miastu Hradec Králové miejscowości Kluky, Třebeš oraz Hrdlořezy wraz z wyrąbanym lasem. W 1451 r. Vít Sexberk został mianowanyJeroným Jan Nepomucký Solař, Dějepis Hradce Králové n. Labem a biskupství hradeckého, Praga 1870 hradeckimj mistrzem mostowym, który miał się zajmować naprawą mostów oraz pobieraniem opłat za przejazd (myta). Jako zapłatę otrzymał miejscowości Kluky oraz Třebeš wraz z domami, rodzinami chłopskimi, polami, łąkami, pastwisky, lasami, i to aż do trzeciej generacji jego roduCzasopismo Královéhradecko, 15. stycznia 1937. Osiemnaście lat później miasto Hradec Králové założyło pod Klukami stawy Datlík oraz Cikán, które zostały w 1835 r. osuszone i odnowione dopiero w 1898 r.
Pod rządami Habsburgów Kluky zostały dwa razy (1547–1549 oraz 1620–1628Tomáš V. Bílek, Dějiny konfiskací v Čechách po r. 1618, Praga 1883) miastu skonfiskowane i później z powrotem oddane. W okresie wojny trzydziestoletniej wieś została doszczętnie spalona.
Kluky pierwotnie zostały przydzielone do parafii kościoła św. Antoniego na Przedmieściu Mýtskim, a po zakończeniu budowy kościoła św. Jana Chrzciciela do jego parafii i w 1772 r. do parafii kościoła św. Antoniego na Novym Hradcu Králové.