Drużyny z miejsc 5–12 miały zapewniony udział w II lidze na kolejny sezon.
Tabela
||rowspan=8|
Baraże o II ligę Po zakończeniu sezonu II i III ligi rozegrano dwumecze barażowe o 4 miejsca w drugiej klasie rozgrywkowej w sezonie 2005/2006 między zespołami z miejsc 13–16 II ligi i wicemistrzami grup III ligi: 13. drużyna II ligi i wicemistrz III ligi grupy II – Piast Gliwice i Unia Janikowo 14. drużyna II ligi i wicemistrz III ligi grupy I – Ruch Chorzów i Znicz Pruszków 15. drużyna II ligi i wicemistrz III ligi grupy III – Szczakowianka Jaworzno i Polonia Bytom 16. drużyna II ligi i wicemistrz III ligi grupy IV – Radomiak Radom i Tłoki Gorzyce.
Jako jedyna z drużyn II ligi swój dwumecz przegrała Szczakowianka, jednak w związku z brakiem licencji na grę w II lidze dla GKS Katowice (spadkowicz z I ligi) pozostała na drugim poziomie rozgrywkowym.
Wynik dwumeczu – 2:2, zwycięstwo Piasta dzięki bramce zdobytej na wyjeździe.
Wynik dwumeczu – 4:4, zwycięstwo Ruchu dzięki większej liczbie bramek zdobytych na wyjeździe.
Wynik dwumeczu – 2:2, zwycięstwo Polonii dzięki bramce zdobytej na wyjeździe.
Wynik dwumeczu – 3:0 dla Radomiaka.