Później przez kilka lat grał w rezerwach Guadalajary: trzecioligowym Chivas San Rafael (8 meczów/2 gole) i bezpośrednim zapleczu pierwszego zespołu – drugoligowym CD Tapatío (15 meczów/2 gole).
Do seniorskiej drużyny został włączony jako osiemnastolatek przez szkoleniowca Efraína Floresa. W meksykańskiej Primera División zadebiutował w ostatniej kolejce regularnej części sezonu Apertura 2007, 10 listopada w wygranym 5:4 spotkaniu z Jaguares na Estadio Jalisco. Występując wówczas z numerem 33 zmienił w 85. minucie jednego ze strzelców goli dla Chivas w tym meczu, Sergio Ávilę i mimo krótkiego czasu spędzonego na placu gry zaprezentował swoją dobrą technikę i panowanie nad piłką. Później młody pomocnik nie wystąpił już w tamtym sezonie ani razu, natomiast zespół Guadalajary zajął czwarte miejsce w tabeli sumarycznej, a w decydującej o mistrzostwie fazie play-off odpadł po półfinałowym dwumeczu (1:0, 0:1) z Atlante. O miejsce w składzie Fabián początkowo rywalizował głównie z Sergio Ávilą. thumb|Fabián (nr 8) podczas spotkania Guadalajary z Cruz Azul w lidze meksykańskiej w kwietniu 2011 Drugi występ w najwyższej klasie rozgrywkowej Fabián zanotował w sezonie Clausura 2008, 2 lutego z Morelią. Zespół Chivas zwyciężył wówczas 6:0, natomiast on sam wybiegł na boisko w pierwszej jedenastce i w 50.