W latach 1999–2002, prowadzono proces restrukturyzacji Spółki mający na celu dostosowanie struktury organizacyjnej i asortymentowej do aktualnych potrzeb rynkowych. Pełny pakiet akcji, Olkuskiej Fabryki Naczyń Emaliowanych „Emalia” SA, zakupił w 2002 prywatny inwestor – rodzina Cader – który doprowadził do restrukturyzacji oraz modernizacji zakładu.
Kontrowersje W 2008 r., z przekształcenia prywatnej spółki Emalia Olkusz sp. z.o.o (KRS: 0000084189), powołanej w 2002 i po wykreśleniu jej z KRS, powstała spółka o nazwie; Emalia Olkusz S.A (KRS 0000298230). Dwie firmy ze słowem Emalia, i nazwą miasta Olkusz, spowodowały zamieszanie na rynku co do prawa używania historycznego znaku towarowego „Olkusz” na swoich wyrobach. Prawo do znaku towarowego po zakupie pełnego pakietu akcji, posiadał tylko prywatny inwestor, właściciel Olkuskiej Fabryki Naczyń Emaliowanych „Emalia” SA.
Spółka, Emalia Olkusz S.A, z powodu długów w 2014 ogłosiła upadłość i uległa likwidacji. 23 lutego 2021 roku dokonano wpisu do rejestru KRS o wykreśleniu spółki Emalia Olkusz S.A z Krajowego Rejestru Sądowego.