W 1998 we Wrocławiu Tomasz Kaczmarek przyczynił się do spowodowania wypadku drogowego, w którym zginęła 27-letnia kobieta. Kierując służbowym pojazdem po godzinach pracy, przekroczył dozwoloną prędkość (miał jechać około 110–150 km/h), a jego samochód zderzył się z innym pojazdem. Sąd skazał Tomasza Kaczmarka na karę roku pozbawienia wolności z warunkowym zawieszeniem na dwuletni okres próby, uznając jednocześnie, iż kierowca drugiego pojazdu również przyczynił się do spowodowania wypadku (poprzez wjechanie na skrzyżowanie przy czerwonym świetle).
Funkcjonariusz CBA W 2006 przeszedł do służby w nowo utworzonym Centralnym Biurze Antykorupcyjnym, gdzie w prowadzonych operacjach działał pod fałszywymi nazwiskami jako Tomasz Małecki lub Tomasz Piotrowski. W 2009 otrzymał tytuł „Człowieka Roku” przyznawany przez „Gazetę Polską” (wyróżnienie odebrał w 2011). Z okresu działalności w CBA głośne stały się trzy sprawy, w których występował pod przykryciem.