Komisja wybrała miejsce usytuowane przy Tidal Basin, bo było bardziej wyniosłe i nie kolidowało z planem zagospodarowania i przebudowy całego Federal Triangle. Pope zaprojektował budynek panteonu z sąsiadującymi mniejszymi prostokątny konstrukcjami ozdobionymi kolumnadami.
Budowa Jefferson Memorial Budowę rozpoczęto 15 grudnia 1938. Kamień węgielny wmurował Franklin Roosevelt 15 listopada 1939. W tym czasie Pope już nie żył. Budową kierowali jego następcy: Daniel P. Higgins i Otto R. Eggers. Pierwotny projekt Popego zmodyfikowano, zabiegając o czystość stylu.
Konstrukcja Jefferson Memorial napotykała przeciwników. Nigdy wcześniej komisja senacka nie zaakceptowała projektu budowli. W 1939 opublikowała nawet pamflet przeciwny samemu pomysłowi jak i miejscu, w którym postanowiono go wybudować. Mieszkańcy miasta sprzeciwiali się, gdyż pierwotny plan urbanizacyjny nie uwzględniał takiej budowli. Musiano by też wyciąć stare wiązy i drzewa wiśni.
W 1939 rozpisano konkurs na projekt statuy prezydenckiej, która miała stanąć w środku panteonu. Zgłoszono 101 projektów, z których ostatecznie wybrano 6. Oficjalnie rzeźbiarzem samej statuy wybrany został . Wyrzeźbienie frontonu zlecono .