mały|250px|Linie kolejowe w Sudanie PołudniowymTransport kolejowy w Sudanie Południowym – system transportu kolejowego działający na terenie Sudanu Południowego.
W Sudanie Południowym istnieje tylko jedna linia kolejowa. Jest to linia Babanusa – Wau licząca 248 km. Jest ona niezelektryfikowana i posiada przylądkowy rozstaw szyn – 1067 mm.
Historia W przededniu odzyskania niepodległości na terenie brytyjskiego Sudanu sieć kolejowa była rozwinięta jedynie w północno-wschodniej części kraju. Stacją najbardziej wysuniętą na południowy zachód było El Obeid. Miasto to leży 500 km od zachodniej granicy kraju i ponad 1000 km od południowej. Po uzyskaniu niepodległości w 1956 władze nowego niepodległego Sudanu za swój priorytet uznały rozbudowę kolei w kierunku zachodnim (Darfur) i południowym w celu integracji tych prowincji. W latach 1956–1957 zostało zbudowane połączenie do Babanusy. Tam zbudowano dwie odnogi – do Nyali (lata budowy: 1957–1959) oraz do Wau (lata budowy: 1959–1962).
Przyszłość Istnieją plany połączenia stolicy kraju Dżuby z sieciami kolejowymi Kenii i Ugandy oraz istniejącą siecią kolejową w Wau. Przy takich połączeniach problemem będzie wybór rozstawu szyn.