Po przejściu na wcześniejszą emeryturę rozpoczął praktykę buddyzmu chan na intensywnych odosobnieniach prowadzonych przez Mistrza Chan Sheng Yena z Dharma Drum Monastery z Tajwanu, która zaowocowała przekazaniem mu 1993 roku prawa nauczania w tradycji chińskiego buddyzmu chanLi, R. (Ed.) 2002. Chan comes West. Dharma Drum Publications.. Tworząc wraz z przyjaciółmi organizację Western Chan Fellowship, John Crook rozwinął program odosobnień medytacyjnych zaadaptowanych na potrzeby ludzi praktykujących na zachodzie.
John Crook opublikował około stu publikacji naukowych z zakresu ornitologii, etologii i psychologii ewolucyjnej oraz kilka książek poświęconych świadomościCrook, J.H. 1980. The Evolution of Human Consciousness. Clarendon. Oxford. oraz praktyce chanCrook, J.H. 2002. Illuminating Silence. Watkins. London. Crook, J.H. 2009. The Koans of Layman John. Lulu. Jego ostatnią pracą była książka ‘World Crisis and Buddhist Humanism’ (New Age Books, Delhi 2009).
Odznaczenia oraz wyróżnienia Członek Centrum Zaawansowanych Studiów Behawioralnych. Uniwersytet Stanforda. 1968-69.
Tablica pamiątkowa. Akademia Sztuki Jammu i Kashmir, Język i kultura. 2003.