Ogółem barwy Atlasu reprezentował bez większych sukcesów przez cztery lata.

Wiosną 2008 Pérez przeniósł się do drugoligowego zespołu Club León, w którym już w pierwszym sezonie, Clausura 2008, wygrał rozgrywki Primera División A. Pełnił jednak wówczas głównie rolę rezerwowego, a wobec porażki w decydującym dwumeczu z Indios sukces jego drużyny nie zaowocował ostatecznie awansem do najwyższej klasy rozgrywkowej. Na początku 2009 roku, po sześciu miesiącach bezrobocia, został zawodnikiem ekipy Potros Chetumal, będącej filią klubu Atlante FC i również występującą w drugiej lidze. Jesienią 2009 reprezentował natomiast barwy innej filii Atlante, drugoligowego Atlante UTN. W styczniu 2010 powrócił do Leónu, z którym w wiosennym sezonie Bicentenario 2010 doszedł do finału drugiej ligi meksykańskiej, pełniąc już wówczas rolę podstawowego bramkarza drużyny.