Hakan Bayraktar (ur. 11 lutego 1976 w Samsunie) – piłkarz turecki grający na pozycji defensywnego pomocnika. Od 2011 roku jest zawodnikiem klubu Mersin İdman Yurdu.
Kariera klubowa Hakan Bayraktar urodził się w Turcji, jednak karierę piłkarską rozpoczął w Belgii, w klubie KFC Lommel. W latach 1995–1997 był zawodnikiem pierwszej drużyny Lommel. W 1997 roku wrócił do Turcji i został zawodnikiem Gaziantepsporu. W 2000 i 2001 roku zajął z Gaziantepsporem 3. miejsce w Süper Lig, najwyższe w historii klubu.
Latem 2001 Hakan Bayraktar przeszedł do Fenerbahçe SK ze Stambułu. Zadebiutował w nim 11 sierpnia 2001 roku w wygranym 3:0 domowym meczu z Samsunsporem. W sezonie 2001/2002 wywalczył z Fenerbahçe wicemistrzostwo kraju, a w sezonie 2003/2004 został z nim mistrzem Turcji.
Na początku 2004 roku Hakan Bayraktar wrócił do Gaziantepsporu i grał w nim przez pół sezonu. Latem odszedł do klubu Akçaabat Sebatspor. Swój debiut w nim zanotował 8 sierpnia 2004 w spotkaniu z Ankarasporem (1:3). W 2005 roku spadł z Akçaabatem Sebatspor do 1. Lig.
W 2005 roku Hakan Bayraktar został zawodnikiem Sivassporu. Swoje pierwsze spotkanie w Sivassporze rozegrał 11 września 2005 przeciwko Galatasaray SK (0:2). W Sivassporze występował do końca 2006 roku.