Ważnymi dla dziejów muzeum były lata 2010 (rocznica bitwy grunwaldzkiej) i 2011 (pięćdziesięciolecie muzeum), podczas których zorganizowano szereg dużych wystaw czasowych m.in. „Fundacje Artystyczne Państwa Zakonu Krzyżackiego” i „Crème de la crème. Najcenniejsze z cennych malborskiego muzeum”.
Dyrektorzy
Henryk Raczyniewski (1961-1973) ? (1975-1987) Mariusz Mierzwiński (1987-2017) Janusz Trupinda (od 2018)
Zbiory thumb|Kolekcja Rzeźby: Chrystus modlący się w Ogrojcu – figura z kościoła Św. Jana w Malborku, ok. 1390 r. Liczące około czterdziestu tysięcy okazów zbiory zostały podzielone na 21 sekcji: Pracownia Archeologiczna Kolekcja Detalu Architektonicznego Kolekcja Rzeźby Płyty i Pomniki Nagrobne Kolekcja Militariów Kolekcja Metali Zabytkowych Kolekcja Bursztynu Kolekcja Ceramiki Kolekcja Kafli Kolekcja Szkła Artystycznego Kolekcja Tkanin Kolekcja Mebli Zabytki Techniki Gabinet Numizmatyczny Kolekcja Malarstwa Kolekcja Witraży Gabinet Rycin Dokumentacja Historyczna Albumy Odbudowy Zamku Kolekcja Ekslibrisu Malboriana