W latach 2004–2008 Alcántar reprezentował barwy drużyny Atlante FC z siedzibą w stołecznym mieście Meksyk. Przez cztery lata był podstawowym zawodnikiem zespołu, gdzie rozegrał 111 meczów w Primera División, czterokrotnie wpisując się na listę strzelców. Właśnie z Atlante wywalczył jedyne w swojej karierze mistrzostwo Meksyku – w rozgrywkach Apertura 2007.
Latem 2008 Alcántar został graczem Tecos UAG z miasta Guadalajara. Z tym zespołem w wieku 33 lat wziął udział w pierwszym międzynarodowym turnieju w karierze, Copa Libertadores 2010, gdzie jednak Tecos odpadli już w rundzie wstępnej. W lipcu 2010 Alcántar za sumę 1,3 miliona euro przeszedł do klubu San Luis FC.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1994/1995 Club León
Primera División 2 0 1995/1996 Club León
Primera División 0 0 1996/1997 Club León
Primera División 0 0 1997/1998 Club León
Primera División 0 0 1998/1999 Club León
Primera División 8 0 1999/2000 Club León
Primera División 33 0 2000/2001 Club León
Primera División 34 0 2001/2002 CF La Piedad
Primera División 18 1 2002/2003 Querétaro FC
Primera División 22 0 2003/2004 CD Irapuato
Primera División 34 1 2004/2005 Atlante FC
Primera División 24 1 2005/2006 Atlante FC
Primera División 32 2 2006/2007 Atlante FC
Primera