Ekstraliga czeska w rugby (2003/2004) – dwunasta edycja najwyższej klasy rozgrywkowej w rugby union w Czechach. Zawody odbywały się w dniach 30 sierpnia 2003 – 3 lipca 2004 roku. Tytułu broniła drużyna RC Tatra Smíchov.
W rozgrywkach triumfowała drużyna RC Říčany pokonując w dwóch meczach finałowych zespół JIMI RC Vyškov. Do I ligi spadł natomiast zespół RC Brno Bystrc przegrywając w barażach o utrzymanie z Slavią Praga.
System rozgrywek Rozgrywki ligowe prowadzone były w pierwszej fazie systemem kołowym według modelu dwurundowego w okresie jesień-wiosna. Druga faza rozgrywek dla czołowych czterech drużyn obejmowała mecze systemem pucharowym o mistrzostwo kraju (play-off do dwóch zwycięstw). Zespoły z dolnej połowy tabeli natomiast rozegrały spotkania o utrzymanie w najwyższej klasie rozgrywkowej ponownie systemem kołowym, otrzymując w zależności od zajętego w fazie zasadniczej miejsca od zera do trzech punktów.
Zwycięzcy półfinałów play-off zmierzyli się w meczach o mistrzostwo kraju, przegrani zaś w meczu o brązowy medal. Najsłabsza drużyna grupy spadkowej rozegrała zaś dwumeczowy baraż ze zwycięzcą I ligi.