W skład tych ostatnich wchodzą 4 kolegia studenckie, 3 instytuty oraz 3 jednostki ogólne.

Wydziały Wydział Techniki Informacyjnej: Instytut Systemów Komputerowych Instytut Oprogramowania Instytut Technologii Zdrowia Instytut Elektroniki T. J. Seebecka Wydział Inżynierski: Instytut Budownictwa i Architektury Instytut Elektrotechniki i Mechatroniki Instytut Technologii Energetycznej Instytut Materiałów i Technologii Materiałowej Instytut Mechaniki i Inżynierii Przemysłowej Wydział Nauk Ścisłych: Instytut Geologii Katedra Chemii i Biotechnologii Instytut Cybernetyki Instytut Systemów Morskich Wydział Ekonomii: Instytut Analizy Ekonomicznej i Finansów Instytut Innowacji i Zarządzania Ragnar Nurkse Instytut Prawa Instytut Zarządzania Biznesem

Instytucje pozawydziałowe Kolegium Kuressaare Kolegium Tallinn Kolegium Virumaa Kolegium Tartu Instytut Geologii Instytut Cybernetyki Instytut Systemów Morskich Technomedicum Centrum Certyfikacji Biblioteka